{ "version": "https:\/\/jsonfeed.org\/version\/1", "title": "Математик среди биологов: заметки с тегом алгоритм", "_rss_description": "Я немного умею складывать, но от вычитания у меня всегда кружится голова", "_rss_language": "ru", "_itunes_email": "", "_itunes_categories_xml": "", "_itunes_image": "", "_itunes_explicit": "", "home_page_url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/tags\/algoritm\/", "feed_url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/tags\/algoritm\/json\/", "icon": false, "author": { "name": "Антон Лях", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/", "avatar": false }, "items": [ { "id": "406", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/kak-napisat-nauchnuyu-statyu-4-rabotayte-parallelno-nad-neskolki\/", "title": "Как написать научную статью. 4. Работайте параллельно над несколькими статьями", "content_html": "

Иногда случается так, что у вас накопился материал на несколько статей, но нет возможности сесть и написать их одну за другой. В этом случае предлагаю работать над статьями параллельно. Для этого необходимо регулярно записывать все возникающие мысли, подходщие цитаты и библиографические ссылки для каждой статьи.<\/p>\n

\n

Регулярно все записывайте<\/big><\/p>\n<\/blockquote>\n

Далее расскажу где и как.<\/p>\n

Где записывать<\/h2>\n

Сначала я пробовал писать рукой<\/a> в разных тетрадках или на отдельных листках бумаги. Это успокаивает, позволяет сосредоточиться и хорошо развивает мелкую моторику. Но когда у меня накопилась весомая стопка, я стал путаться, где, что и когда записал.<\/p>\n

Потом пробовал записывать в Ворде (вместо Ворда подставьте название любимого текстового редактора). Но тогда я стал путаться, в какой файл я внес запись и где он лежит.<\/p>\n

Сейчас я перешел на Эгею<\/a>.<\/p>\n

Эгея — это движок для ведения блога, созданный Ильей Бирманом. Ее легко установить, в ней просто работать. Этот блог работает на Эгее.<\/small><\/p>\n

Эгея умеет хранить черновики заметок, которые видны только вам. (В платной версии вы можете отправить ссылку на черновик кому-то еще, но я работаю в бесплатной.) Именно черновики идеально подходят для параллельной работы над статьями.<\/p>\n

\n

Записывайте в черновиках блогодвижка<\/big><\/p>\n<\/blockquote>\n

Вместо Эгеи можно взять любой другой блогодвижок. Главное, чтобы он помогал сосредоточенно работать над текстом, а не думать о том, где это текст лежит.<\/p>\n

Как записывать<\/h2>\n

Веду два черновика<\/i>
\nДля каждой статьи я завожу два черновика. В одном веду список литературы, в другом — пишу текст, вставляю иллюстрации или воспроизвожу фразы из чужих работ.<\/p>\n

Использую иллюстрации<\/i>
\nВ текст вставляю иллюстрации. Это помогает понять, как они будут смотреться в реальной статье. Однако исходники иллюстраций все-таки храню в отдельной папке на компе, потому что из Эгеи тяжело вытаскивать картинки.<\/p>\n

Привожу цитаты<\/i>
\nВ тексте не боюсь использовать фразы из чужих работ. Многое из того, что вы только-что придумали, кто-то уже опубликовал. Поэтому когда вы находите абзац, в котором автор пишет то, о чем вы думайте — просто скопируйте этот абзац.<\/p>\n

\n

Пересказывайте опубликованные мысли<\/big><\/p>\n<\/blockquote>\n

Обратите внимание на то, как автор выражает мысли, какой стиль использует. Если вам нравится, попробуйте также выразить свои идеи. Естественно, что в чистовике вы передадите мысль автора своими словами с обязательной ссылкой на первоисточник.<\/p>\n

Если вы считаете, что все-таки сами додумались до всего, тогда ни на кого ссылаться не нужно. Но если рецензент вашей работы будет настаивать, что об этом таки-давно известно, тогда напишите, что об этом действительно говорил тот и тот автор, но вы сами независимо пришли к данному заключению.<\/p>\n

Ссылаюсь на авторов и год публикации<\/i>
\nВ тексте ссылаюсь на статьи по имени первого автора и году<\/a>, записываю в квадратных скобках: [Иванов, 1913], [Bond et al., 1956], [Пух, Пятачок, 1980]. По такой ссылке легко отыскать первоисточник. Она намного удобнее абстрактных чисел: [1, 7, 15]. Не могу понять, почему в отечественных изданиях упорно продолжают использовать числовые ссылки. Редакторы, пора с этим заканчивать!<\/p>\n

Кратко конспектирую библио-источники<\/i>
\nВ библиографическом списке после каждой статьи кратко описываю, чем она полезна, что из нее стоит взять, почему решил на нее сослаться. Если статья оказалась никчемной — тоже заношу ее в спиской с соответствующей пометкой, чтобы больше не ссылаться.<\/p>\n

\n

Кратко конспектируйте библио-ссылки<\/big><\/p>\n<\/blockquote>\n

Все библио-ссылки переношу в библио-менеджер. Я использую собственный библио-менеджер. С его помощью, например, сформирован список прочитанных книг<\/a> и моих публикаций<\/a>.<\/p>\n

Это главные рекомендации. Есть еще детали, но я их вовремя не записал и теперь забыл.<\/p>\n

Что делать<\/h2>\n
    \n
  1. Работайте над статьями параллельно.<\/li>\n
  2. Регулярного все записывайте.<\/b><\/li>\n
  3. Пересказывайте чужие мысли.<\/li>\n
  4. Ссылайтесь на публикации по автору и году.<\/li>\n
  5. Храните исходники иллюстраций для каждой статьи.<\/li>\n
  6. Чередуйте сидячую работу с подвижным отдыхом.<\/b><\/li>\n
  7. Будьте здоровы.<\/li>\n<\/ol>\n", "date_published": "2020-11-17T13:25:49+03:00", "date_modified": "2020-11-17T13:25:12+03:00", "_date_published_rfc2822": "Tue, 17 Nov 2020 13:25:49 +0300", "_rss_guid_is_permalink": "false", "_rss_guid": "406", "_e2_data": { "is_favourite": true, "links_required": [], "og_images": [] } }, { "id": "400", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/metaalgoritmicheskiy-yazyk\/", "title": "Метаалгоритмический язык", "content_html": "

    Выдержки из статьи В. Ф. Турчина (1968) «Метаалгоритмический язык<\/a>». Кибернетика, № 4. C. 45-54.<\/p>\n

    Цель<\/h3>\n

    Метаалгоритмический язык (метаязык) задуман для формального описания семантики алгоритмических языков.<\/p>\n

    Метаязык — алгоритмический язык<\/h3>\n

    Метаязык сам является алгоритмическим языком. На любом универсальном алгоритмическом языке можно описать семантику любого другого алгоритмического языка. Поэтому выбор того или иного алгоритмического языка в качестве метаязыка — это вопрос удобства. Хотя на практике, «неудобство» часто означает «невозможность».<\/p>\n

    Метаязык для человека, а не для машины<\/h3>\n

    Так как речь идет о формалных семантических описаниях, предназначенных для использования человеком, выбранный алгоритмический метаязык должен быть удобен для человека. Поскольку алгоритм — в сущности, инструкция для машины, то проблема метаязыка — это проблема общения человека с машиной, удобного не для машины, а для человека.<\/p>\n

    Машинно-независимые алгоритмические языки удобны для записи задач из определенной области вследствие того, что они строятся на основе формализации ряда понятий, важных и характерных для данной специальной области. Тогда как нам нужен язык предназначенный для описания любых языков и понятий — метаязык. Такой язык будет удобен для человека лишь в том случае, если он схватит какие-то чрезвычайно общие и в то же время важные черты человеческого мышления.<\/p>\n

    Особенности человеческого языкового мышления<\/h3>\n

    В поисках таких черт обратимся к естественным языкам и их продолжению — формализованным языкам математики. Важнейшей чертой этих языков является наличие в них иерархии понятий<\/i>. Она возникает благодаря особенности мозга абстрагироваться от многих конкретных ситуаций и создавать языковые модели действительности. Путем конкретизации, они, затем, используются в любой подходящей ситуации.<\/p>\n

    Иерархия понятий в естественном языке: морфемы — лингемы — абстрактные и сложные понятия<\/h3>\n

    Естественный язык можно представить в виде многоэтажной пирамиды, построенной на почве чувственного опыта. При семантическом подходе элементами этой пирамиды надо считать морфемы<\/i> — минимальные смысловые единицы языка. Складываясь в цепочки, морфемы образуют языковые объекты — лингемы<\/i>: слова, группы слов, прдложения.<\/p>\n

    Языковые объекты, расположенные на самых низких этажах пирамиды, фиксируют наиболее конкретные, близкие к чувственному опыту понятия: «больно», «холодно», «заяц», «камень». На их основе строятся более абстрактные и более сложные понятия. На их основе — еще более сложные и так далее. Все эти понятия фиксируются языковыми объектами.<\/p>\n

    Где-то на средних этажах пирамиды расположены понятия «север», «число», «работа», «чин». А где-то на самом верху — «отчуждение», «гомозиготный», «бикомпактность».<\/p>\n

    Мера абстрактности и сложности понятий<\/h3>\n

    В естественнм языке нельзя ввести точную меру абстрактности или сложности понятия и распределить соответствующие элементы по этажам. Поэтому нашу пирамиду следует понимать условно и иллюстративно. Однако принцип образования сложных и абстрактных понятий путем композиции и абстрагирования от более простых и конкретных, несомненно, лежит в основе построения языков.<\/p>\n

    Что значит понимать<\/h3>\n

    Возьмем какой-нибудь языковый объект, например слово, и зададим вопрос: что значит понимать это слово? Очевидно, что физический носитель языка не имеет никакого значения. Имеют значение лишь связи этого слова с другими словами — комплексами ощущений, а в конечном счете с чувственным опытом. Следовательно, понимать слово — значит пройти в обратном направлении путь его построения.<\/p>\n

    Понимать абстрактное понятие — значить уметь его конкретизировать (в каждой заданной ситуации).<\/p>\n

    Понимать сложное понятие — значить уметь свести его к ряду более простых.<\/p>\n

    Конкретизация<\/h3>\n

    Оба действия (понять абстрактное и сложное понятия) означают замену языкового объекта, занимающего более высокое положение в языковой пирамиде, на ряд объектов, занимающих более низкое положение. Эту операцию назовем конкретизацией<\/i> языковго объекта.<\/p>\n

    При некоторых видах деятельности мы не доводим ее до комплекса ощущений, однако предполагается, что знаем, как это сделать. Иначе слово не имеет для нас никакого смысла.<\/p>\n

    \n

    Cемантика языкового объекта определяется правилом его конкретизации<\/i>. Семантика языка — совокупностью правил конкретизации<\/i>, которая позволяет путем ряда шагов свести каждый объект к некоторым несводимым элементарным объектам.<\/p>\n<\/blockquote>\n

    Формальная основа метаязыка<\/h3>\n

    Нарисованная схема определения семантики объектов естественного языка является очень упрощенной. Однако без упрощения невозможна никакая формализация.<\/p>\n

    Задача метаязыка заключается в формализации семантических описаний. Поэтому при построении металагоритмического языка эта схема была принята за основу.<\/p>\n

    Металагоритмическая машина<\/h3>\n

    Семантика метаалгоритмического языка определяется метаалгоритмической машиной. Она выполняет конкретизацию выражения в соответствии с имеющимся набором предложений. Следовательно, работа этой машины моделирует языковую деятельность человека.<\/p>\n

    \n

    Работа метаалгоритмической машины моделирует<\/i> языковую деятельность человека.<\/p>\n<\/blockquote>\n

    Таким образом, метаалгоритмическая машина «умнее» и сложнее, чем машина Тьюринга. Последняя моделирует только сам факт языковой деятельности — так сказать языковость деятельности.<\/p>\n

    Метаалгоритмическую машину можно рассматривать как следующий шаг на пути приближения машины кчеловеку. Поэтому общение с такой машиной протекает более «человеческим» способом и удобнее для человека, чем общение с машиной Тьюринга.<\/p>\n

    Моделирование мыслительных процессов<\/h3>\n

    Алгоритм — набор предложений на метаалгоритмическом языке — может быть построен, как иерархия понятий все более сложных и специальных. Поскольку построение иерархии понятий является необходимым и, быть может, основным элементом человеческого мышления, метаалгоритмический язык может оказаться полезным для изучения и моделирования мыслительных процессов. Потому что оно позволяет формализованно рассмотреть иерархию понятий.<\/p>\n

    Общение человека с машиной и моделированиечеловеческого мышления — это, по существу, две стороны одной медали.<\/p>\n

    * * *<\/p>\n

    Формальное и неформальное описание метаязыка, примеры алгоритмов смотрите в статье<\/a>.<\/p>\n", "date_published": "2020-10-24T23:34:38+03:00", "date_modified": "2020-10-24T23:35:41+03:00", "_date_published_rfc2822": "Sat, 24 Oct 2020 23:34:38 +0300", "_rss_guid_is_permalink": "false", "_rss_guid": "400", "_e2_data": { "is_favourite": true, "links_required": [], "og_images": [] } }, { "id": "393", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/statya-ot-pervogo-lica\/", "title": "Как написать научную статью. 3. Пишите в активном залоге с ясным подлежащим и сказуемым", "content_html": "

    Мне несколько раз говорили, что писать научные статьи от первого лица не принято. Надо писать косвенно: от третьего лица или в пассивном залоге. В редком случае можно написать мы,<\/i> даже если я — единственный автор.<\/p>\n

    \n
    \n\"\"\n<\/div>\n<\/blockquote>\n
    \n
    \n\"\"\n<\/div>\n<\/blockquote>\n

    Потом появился главред Макс Ильяхов и стал учить писать в информационном стиле: в активном залоге, без отглагольных существительных, лаконично, честно, с подлежащим и сказуемым<\/a>.<\/p>\n

    Но еще задолго до Макса нормальные авторы писали энергично.<\/p>\n

    \n

    Я предпринял большие дела: построил себе дома, посадил себе виноградники, устроил сады и рощи и насадил в них всякие плодовитые дерева; сделал себе водоемы для орошения садов и рощь; приобрел себе слуг и служанок, и домочадцы были у меня; также крупного и мелкого скота было у меня больше, нежели у всех, бывших прежде меня; собрал себе серебра и золота и драгоценностей от царей и областей; завел у себя певцов и певиц и разные музыкальные орудия.<\/p>\n<\/blockquote>\n

    Поэтому, если вы взялись за статью — пишите в активном залоге, от первого или второго лица, с ясным подлежащим и сказуемым.<\/p>\n

    \n

    Мы изучили изменчивость пропорций крыльев летучих мышей и выяснили, что рукокрылые пещеры Ясная имеют более длиные и узкие крылья, чем рукокрулые пещеры Сквозная. Нам кажется, что пропорции крыльев связаны с плотностью сталактитов и сталагмитов на квадратном метре ходов пещер. Мы проверим это предположение после изучения других пещер южной горной гряды.<\/p>\n<\/blockquote>\n

    Я рекомендую так писать каждому исследователю. А чтобы научиться — изучите «Справочник Главреда<\/a>», пишите чаще и читайте хорошие книги.<\/p>\n

    \n
    \n\"\"\n<\/div>\n<\/blockquote>\n

    И не забудьте отдохнуть<\/a>.<\/p>\n", "date_published": "2020-09-27T23:56:51+03:00", "date_modified": "2020-09-29T15:06:48+03:00", "image": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/asymmetry-fragment.png", "_date_published_rfc2822": "Sun, 27 Sep 2020 23:56:51 +0300", "_rss_guid_is_permalink": "false", "_rss_guid": "393", "_e2_data": { "is_favourite": true, "links_required": [], "og_images": [ "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/asymmetry-fragment.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/vasilyev-i-dr-2018-primer.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/bratya-karamazovy-frashment.png" ] } }, { "id": "384", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/kak-napisat-poleznuyu-nauchnuyu-statyu-2-otdohnite\/", "title": "Как написать научную статью. 2. Отдохните", "content_html": "

    Если сесть и начать писать статью не получается — отдохните.<\/p>\n

    Послушайте музыку. Порисуйте. Погуляйте на природе. Подышите свежим воздухом без маски, если вы до сих пор ее носите.<\/p>\n

    Научитесь качественно расслабляться. Для этого освойте шавасану<\/i><\/a><\/b>.<\/p>\n

    Соберитесь мыслями и садитесь за статью. Предварительно решите, о чем писать не будете<\/a>.<\/p>\n", "date_published": "2020-09-07T00:00:00+03:00", "date_modified": "2020-09-27T23:57:49+03:00", "_date_published_rfc2822": "Mon, 07 Sep 2020 00:00:00 +0300", "_rss_guid_is_permalink": "false", "_rss_guid": "384", "_e2_data": { "is_favourite": true, "links_required": [], "og_images": [] } }, { "id": "379", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/kak-napisat-nauchnuyu-statyu-1-reshite-o-chem-pisat-ne-budete\/", "title": "Как написать научную статью. 1. Решите, о чем писать не будете", "content_html": "

    В последнее время у меня случился творческий кризис: не могу написать ничего внятного длиннее двух предложений. А писать надо, так как за статьи нам начисляют баллы<\/a>, а за баллы дают квартальную премию, и, в целом, это моя обязанность. Решил разобраться, как написать полезную научную статью.<\/p>\n

    Научный сотрудник производит публикации<\/h2>\n

    Результатами работы любого научного сотрудника являются научные статьи. Когда мы отчитываемся, претендуем на повышение должности, подаем заявки на гранты — все оценивают, сколько статей мы написали и в каких журналах опубликовали. Желательно, чтобы статьи были в высокорейтинговых журналах, которые индексируются Веб оф сайнс (ВОЗ).<\/p>\n

    Не путайте с ВОЗом, заставившим нас сидеть дома.<\/p>\n

    Большой секрет<\/h2>\n

    Скажу по большому секрету: качество опубликованных статей абсолютно никого не интересует. Иначе нас окружали бы только полезные и крайне интересные работы.<\/p>\n

    \n

    Качество научных публикаций никого не интересует<\/big><\/p>\n<\/blockquote>\n

    Считается, что за качество статей отвечают рецензенты и редактор журнала. То есть, контроль качества осуществляют три-четыре человека. Они часто с вами не знакомы, имеют свои принципы и амбиции. Поэтому их оценки часто субъективны и несправедливы.<\/p>\n

    Кроме того, есть риск, что опубликованные в статье идеи будут рецензентами «зарезаны», а потом использованы ими же в своих статьях. Именно для таких случаев рекомендуют новые интересные результаты предварительно печатать в открытых репозиториях: Биорхив<\/a> — для биологов, Архив<\/a> — для математиков, физиков, программистов и цифровых биологов.<\/p>\n

    Самый большой секрет<\/h2>\n

    Скажу еще по одному очень большому секрету: публикацию в некоторых журналах можно купить. Не заплатить за открытый доступ к статье (хотя это тоже своеобразная покупка публикации), а именно купить за фейковую рецензию. Такую практику, как ни странно, используют некоторые отечественные журналы. За это им стыд, позор и минус в карму. А я публикуюсь только в бесплатных журналах<\/a>.<\/p>\n

    Если вы такой же, продолжим.<\/p>\n

    Итак, писать надо, надо писать много, а не получается. Что делать?<\/p>\n

    Путь к написанию статьи<\/h2>\n

    И тут я вспомнил, что умею хорошо программировать. Значит — формулировать алгоритмы. «Ну-ка, придумай алгоритм написания статьи», — сказал я себе и сел думать.<\/p>\n

    Первое, что я придумал: надо четко решить, о чем писать не надо.<\/p>\n

    \n

    Надо решить, о чем не писать<\/big><\/p>\n<\/blockquote>\n

    Этот совет подсмотрел у Темы Лебедева «Выбор направления деятельности<\/a>».<\/p>\n

    Этого совета достаточно и дальше можно не читать. Потому что дальше я рассуждаю узко, о чем сам не буду писать.<\/p>\n

    Не писать локальные заметки<\/i><\/h2>\n

    Итак, я не буду писать локальные заметки<\/i>. Это заметки о состоянии чего-то там в каком-то маленьком районе в какой-то конкретный момент времени.<\/p>\n

    Локальные заметки имеют примерно такие названия:<\/p>\n