https://antonlyakh.ru/blog/tags/bioinformatika/ Я немного умею складывать, но от вычитания у меня всегда кружится голова Антон Лях ru E2 (v3559; Aegea) Антон Лях Я немного умею складывать, но от вычитания у меня всегда кружится голова 514 https://antonlyakh.ru/blog/all/neustoychivost-filogneticheskogo-dereva/ Sun, 16 Mar 2025 23:59:20 +0300 Антон Лях https://antonlyakh.ru/blog/all/neustoychivost-filogneticheskogo-dereva/ <div class="e2-text-picture"> <img src="https://antonlyakh.ru/blog/pictures/fbstraktnoe-filogeneticheskoe-drevo.png" width="800" height="800" alt="" /> </div> <p class="loud">Филогенетическое дерево, построенное по молекулярно-генетическим данным, неустойчиво.</p> <p>Потому, что:</p> <ul> <li>если к имеющемуся множеству последовательностей добавить пару десятков новых и перестроить дерево, то это его изменит;</li> <li>если мы поменяем способ объединения (группировки) данных, то это тоже изменит дерево;</li> <li>если мы возьмем молекулярные данные другого сорта, то и это изменит дерево.</li> </ul> <p>Следовательно, структура филогенетического дерева непостоянна.</p> <hr /> <p>Об этом же <a href="https://ru.wikipedia.org/wiki/Филогенетическое_дерево#Ограничения_использования_филогенетических_деревьев">пишет википедия</a>:</p> <blockquote> <p>[...] дерево, построенное на основе ограниченных данных (например, последовательности единственного гена или белка), требует скептического отношения к себе, потому что дерево, построенное на основе другого независимого источника данных, нередко будет отличаться от первого.</p> </blockquote> <blockquote> <p>[...] реконструкция филогенетического дерева представляет собой оценку филогении особенностей (например, эволюционной истории какого-либо отдельного гена), а не филогении организмов, из которых были отобраны эти особенности, хотя в идеале обе филогении должны быть близки друг к другу.</p> </blockquote>