{ "version": "https:\/\/jsonfeed.org\/version\/1", "title": "Математик среди биологов: заметки с тегом интерфейс", "_rss_description": "Я немного умею складывать, но от вычитания у меня всегда кружится голова", "_rss_language": "ru", "_itunes_email": "", "_itunes_categories_xml": "", "_itunes_image": "", "_itunes_explicit": "", "home_page_url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/tags\/interfeys\/", "feed_url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/tags\/interfeys\/json\/", "icon": false, "author": { "name": "Антон Лях", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/", "avatar": false }, "items": [ { "id": "423", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/dispersionny-analiz-srednih-dlin-rakovin-mollyuskov\/", "title": "Дисперсионный анализ средних длин раковин моллюсков", "content_html": "

Коллега попросил помочь с выполнение дисперсионного анализа. Рассказываю, что получилось.<\/p>\n

У нас есть три ряда длин раковин моллюсков, полученные в три разных года: 1981, 1998 и 2012. Мы хотим узнать, есть ли статистически достоверное различие между средними длинами в каждый период или нет? Расскажу, как это сделать.<\/p>\n

\n $\"\"$ \n

Фрагмент исходных данных<\/div>\n<\/div>\n

Сначала посмотрим на статистическое описание данных.<\/i><\/p>\n

\n $\"\"$ \n<\/div>\n
Средние и медианы неплохо отличаются, наверное различия все-таки есть.<\/p>\n
Потом построим диаграммы размахов,<\/i> в простонародье — ящики с усами.<\/i><\/p>\n
\n $\"\"$ \n<\/div>\n
Второй и третий ящики практически полностью пересекаются с первым. Значит различия недостоверны?<\/p>\n
Теперь попробуем попарно сравнить средние при помощи t-теста стьюдента:<\/i> первое со вторым, второе с третьим и третье с первым. Наши данные независимы, потому что мы каждый раз измеряли разных моллюсков. Значит применим t-тест для независимых выборок. Но предварительно проверим данные на нормальность. Если выборки имеют нормальное распределение, используем t-тест. Если ненормальное, прочитаем Сергея Мастицкого<\/a> (стр. 36):<\/p>\n
\n
Если значение распределены ненормально, применение параметрического t-теста будет часто приводить к искаженным результатам. В таких случаях следует воспользоваться непараметрическим аналогом теста стьюдента. Например можно использовать u-тест манна-уитни.<\/p>\n<\/blockquote>\n
Вперед.<\/p>\n
\n
\n $\"\"$ \n $\"\"$ \n $\"\"$ \n<\/div>\n
Попарные сравнения u-тестом манна-уитни<\/div>\n<\/div>\n
Попарные сравнения показали отличия средних.<\/p>\n
А теперь читаем книгу Мастицкого уже на стр. 43:<\/p>\n
\n
Тесть стьюдента и его непараметрические аналоги предназначены для сравнения исключительно двух выборок.<\/i> Очень часто исследователи допускают ошибку: используют t-тест для попарных сравнений более двух выборок.<\/p>\n<\/blockquote>\n
Надо же, оказывается мы допустили частую ошибку статистических профанов. И как нам быть?<\/p>\n
\n
Для избежания данной ошибки необходимо использовать дисперсионный анализ.<\/p>\n<\/blockquote>\n
Алилуя! Но теперь надо прочитать хорошие книги о дисперсионном анализе<\/a>?<\/p>\n
Нет, совсем не обязательно. Автоматизация статистических вычислений, в настоящее время, достигла таких высот, что вам всего лишь нужно нажать правильные кнопки. Все остальное сделает машина. Например так работает Сигмаплот. Он сам проверит данные на нормальность и выберет правильный тип дисперсионного анализа.<\/p>\n
Наши данные оказались ненормальными, поэтому Сигмаплот предложил непараметрический дисперсионный анализ крускала-уолиса (H-тест)<\/i> и объяснил полученные результаты.<\/p>\n
\n $\"\"$ \n<\/div>\n
Если бы мы воспользовались Статистикой или Эр, нам пришлось бы интерпретировать полученные цифры. Для этого следует хорошо разобраться в дисперсионном анализе и сопутствующих методах. То есть пройти хороший курс биометрии.<\/p>\n
Но тот-кто-знает, что «интерфейс — зло<\/a>» и «потеть должна машина<\/a>», тот выберет способ «нажал на кнопку и получил развернутый ответ». Мозги, в этом случае, пригодятся для интерпретации ответа.<\/p>\n
$\"Пирамида$ Пирамида Лебедева<\/a><\/small><\/p>\n
Выбирайте сами. И, да — это не реклама Сигмаплота. Просто мне понравилось, как он интерпретировал результат.<\/p>\n
Книги, в любом случае, читать полезно.<\/p>\n", "date_published": "2021-03-27T00:00:31+03:00", "date_modified": "2022-11-06T00:00:43+03:00", "image": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/Ishodnye-dannye.png", "_date_published_rfc2822": "Sat, 27 Mar 2021 00:00:31 +0300", "_rss_guid_is_permalink": "false", "_rss_guid": "423", "_e2_data": { "is_favourite": true, "links_required": [ "system\/library\/jquery\/jquery.js", "system\/library\/fotorama\/fotorama.css", "system\/library\/fotorama\/fotorama.js" ], "og_images": [ "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/Ishodnye-dannye.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/Opisatelnaya-statistika.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/Diagrammy-rasseyaniya.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/t-test-1981-1998.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/t-test-2012-1998.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/t-test-2012-1981.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/kruskal-wallis-anova.png" ] } }, { "id": "200", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/sila-primerov\/", "title": "Сила примеров", "content_html": "
Это выжимка из заметки Антона Жиянова<\/a>. Антон снимает шелуху с интерфейсов<\/a>, обнажая их идеальную сущность.<\/p>\n
\n
[...]<\/p>\n<\/blockquote>\n
\n
Для меня лучшая формула обучения чему угодно — «порция теории + вагон примеров». Забавно, что при этом для большинства преподавателей (да и вообще профессионалов) выдать примеры — огромная трудность.<\/p>\n<\/blockquote>\n
\n
Любой спец с лёгкостью напишет, как «лучше быть богатым и здоровым, чем бедным и больным» — но заскрипит на примерах. Если попросить профи написать статью — он изложит десяток хороших и правильных принципов, и в лучшем случае один натужный пример (хорошо если не выдуманный).<\/p>\n<\/blockquote>\n
\n
Я думаю, что успех рассылок и курсов Ильяхова именно в том, что он всегда и всё подаёт на примерах. То же самое в других хороших курсах — например, «Аналитике для предпринимателей» Алексея Куличевского или «Better Web Type» Матея Латина. То же самое стараюсь делать и я в «Интерфейсах для нормальных людей».<\/p>\n<\/blockquote>\n
\n
Кажется, от примеров выигрывает всё что угодно.<\/p>\n<\/blockquote>\n", "date_published": "2018-03-16T02:13:11+03:00", "date_modified": "2018-03-16T02:12:37+03:00", "_date_published_rfc2822": "Fri, 16 Mar 2018 02:13:11 +0300", "_rss_guid_is_permalink": "true", "_rss_guid": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/sila-primerov\/", "_e2_data": { "is_favourite": true, "links_required": [], "og_images": [] } }, { "id": "120", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/kak-ne-nuzhno-delat-poisk-taksonov-v-mikobanke\/", "title": "Как не нужно делать поиск таксонов: пример Микобанка", "content_html": "
Микобанк<\/a> — база данных с научными названиями грибов.<\/p>\n
\n $\"\"$ \n<\/div>\n
В конце 2015 года база содержала более 360 тыс. видовых, около 50 тыс. внутривидовых и свыше 3 тыс. названий высших таксонов.<\/p>\n
\n $\"\"$ \n
Круговые диаграммы здесь не нужны — достаточно написать число таксонов<\/div>\n<\/div>\n
Что имеем<\/h2>\n
Простая функция перечисления всех названий видов грибов в Микобанке отсутствует. Если вы не знаете вида гриба — вы не узнаете ничего. База для гиков-микологов.<\/p>\n
Микобанк предлагает шесть вариантов поиска: простой, базовый, продвинутый, типовых экземпляров, терминов и библиографических ссылок.<\/p>\n
\n $\"\"$ \n<\/div>\n
Простой поиск сложен. Пробую найти информацию о белом грибе с установленным флажком семейства — система ничего не находит.<\/p>\n
\n $\"\"$ \n<\/div>\n
Базовый поиск еще сложнее. Он содержит несколько полей и дополнительно предлагает сконструировать запрос. Я умею программировать и понимаю, что от меня хотят. Гики-микологи тоже разберуться, нормальные биологи — вряд ли.<\/p>\n
После праздников промахиваюсь и пишу название вида в поле для идентификатора записи базы данных. Система ничего не находит.<\/p>\n
\n $\"\"$ \n<\/div>\n
В продвинутом поиске число полей в 1,5 раза больше. Ухожу с сайта.<\/p>\n
Как надо<\/h2>\n
Для поиска достаточно оставить одно поле, а разбор запроса передать системе.<\/p>\n
\n $\"\"$ \n
Воображаемый поиск в Микобанке<\/div>\n<\/div>\n
Так программировать сложно, но чтобы расти, этому надо учиться.<\/p>\n
На чем учиться<\/h2>\n
Микобанк разрешает скачать список научных названий грибов<\/a> (25 Мбт). Это большой интересный набор данных. С его помощью вы разберетесь с названиями таксонов, научитесь строить таксономическую базу данных<\/a> и прокачаете навыки разработки интерфейсов.<\/p>\n
О достижениях пишите.<\/p>\n
Спасибо Бюро Артема Горбунова за принцип «Интерфейс — зло<\/a>».<\/small><\/p>\n", "date_published": "2017-01-07T17:31:59+03:00", "date_modified": "2017-01-07T17:35:36+03:00", "image": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/mycobank-database.png", "_date_published_rfc2822": "Sat, 07 Jan 2017 17:31:59 +0300", "_rss_guid_is_permalink": "true", "_rss_guid": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/kak-ne-nuzhno-delat-poisk-taksonov-v-mikobanke\/", "_e2_data": { "is_favourite": true, "links_required": [], "og_images": [ "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/mycobank-database.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/mycobank-stat.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/mycobank-search-variants.gif", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/mycobank-simple-search.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/mycobank-basic-search.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/mycobank-new-search.png" ] } } ], "_e2_version": 3559, "_e2_ua_string": "E2 (v3559; Aegea)" }