<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> 
<rss version="2.0"
  xmlns:itunes="http://www.itunes.com/dtds/podcast-1.0.dtd"
  xmlns:atom="http://www.w3.org/2005/Atom">

<channel>

<title>Математик среди биологов: заметки с тегом мера схожести</title>
<link>https://antonlyakh.ru/blog/tags/mera-shozhesti/</link>
<description>Я немного умею складывать, но от вычитания у меня всегда кружится голова</description>
<author>Антон Лях</author>
<language>ru</language>
<generator>E2 (v3559; Aegea)</generator>

<itunes:owner>
<itunes:name>Антон Лях</itunes:name>
<itunes:email></itunes:email>
</itunes:owner>
<itunes:subtitle>Я немного умею складывать, но от вычитания у меня всегда кружится голова</itunes:subtitle>
<itunes:image href="" />
<itunes:explicit></itunes:explicit>

<item>
<title>Степень доверия к списку таксонов</title>
<guid isPermaLink="false">417</guid>
<link>https://antonlyakh.ru/blog/all/stepen-doveriya-k-spisku-taksonov/</link>
<pubDate>Wed, 27 Jan 2021 14:19:41 +0300</pubDate>
<author>Антон Лях</author>
<comments>https://antonlyakh.ru/blog/all/stepen-doveriya-k-spisku-taksonov/</comments>
<description>
&lt;p&gt;&lt;a href="https://antonlyakh.ru/blog/all/o-raznice-mezhdu-sistematikom-i-taksonomistom/"&gt;Настоящие таксономисты&lt;/a&gt; любят публиковать  &lt;s&gt;длинные&lt;/s&gt; списки видов, обнаруженных в каком-нибудь интересном месте. Отечественные исследователи часто называют их &lt;i&gt;чеклистами.&lt;/i&gt; Звучит загадочно и, как и любой англицизм, придает весомость научной работе. (По мнению среднестатистического обывателя.)&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;Списки видов обычно публикуют, когда проведена большая работа, исследован обширный материал, систематизирована масса литературных источников, а в результате — сказать особо не о чем, за редким исключением.&lt;/p&gt;
&lt;div class="e2-text-picture"&gt;
&lt;img src="https://antonlyakh.ru/blog/pictures/bryantseva_2020_dinofito.png" width="800" height="344" alt="" /&gt;
&lt;div class="e2-text-caption"&gt;&lt;i&gt;Брянцева Ю. В.&lt;/i&gt; 2020. Динофлагеляти Кримського півострова та його морського прибережжя&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;p&gt;Несомненно, списки видов полезны. Но к ним, все-таки, следует относиться с определенной долей скепсиса.&lt;/p&gt;
&lt;h2&gt;Степень доверия к таксономическому списку&lt;/h2&gt;
&lt;p&gt;Степень доверия определяется тем, насколько находка конкретного вида подтверждена типовым материалом. Чтобы не утруждать любимого читателя занудной классификацией типовых экземпляров, упрощю определение:&lt;/p&gt;
&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;&lt;big&gt;&lt;i&gt;Простая мера доверия к таксономическому списку&lt;/i&gt; зависит от наличия изображений видов, упомянутых в списке.&lt;/big&gt;&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;p&gt;Простая мера доверия выражается числом от единицы до трех:&lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
&lt;li&gt;1 — изображений нет,&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;2 — есть изображения среднего качества,&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;3 — есть изображения отличного качества.&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
&lt;p&gt;Значение меры может быть вещественным. Чем ниже мера, тем меньше доверия и больше скепсиса.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;Поясню на примере чеклистов диатомовых.&lt;/p&gt;
&lt;h2&gt;Степень доверия к списку видов диатомовых водорослей&lt;/h2&gt;
&lt;p&gt;Любой профессиональный диатомолог скажет, что:&lt;/p&gt;
&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;Для корректного опознания вида диатомовой водоросли необходимо изображение панциря, полученное с разных ракурсов с помощью сканирующего электронного микроскопа (СЭМ), а также изображения живой микроводоросли с протопластом.&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;p&gt;Отсюда:&lt;/p&gt;
&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;3 → &lt;i&gt;Максимальное доверие&lt;/i&gt; у списка диатомовых, в котором каждый вид сопровождают фотографии, полученные с помощью СЭМ, и фотографии живых организмов.&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;2 → &lt;i&gt;Среднее доверие&lt;/i&gt; у списка, в котором каждый вид проиллюстрирован фотографиями, выполненные под световым микроскопом (СМ).&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;1 → &lt;i&gt;Минимальное доверие&lt;/i&gt; у списка, в котором только перечислены виды.&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;2...3 → Есть СЭМ и СМ фотографии. Чем больше СЭМ, и больше фото живых клеток, тем ближе к трем.&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;1...2 → Есть СМ фото и есть виды без фото. Чем больше видов без фото, тем ближе к единице.&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;h2&gt;Примеры&lt;/h2&gt;
&lt;h3&gt;Доверие единица&lt;/h3&gt;
&lt;div class="e2-text-picture"&gt;
&lt;img src="https://antonlyakh.ru/blog/pictures/ryabushko-2011.png" width="373" height="400" alt="" /&gt;
&lt;div class="e2-text-caption"&gt;&lt;i&gt;Рябушко Л. И., Бондаренко А. В.&lt;/i&gt; 2011. Микроводоросли планктона и бентоса Азовского моря (чек-лист, синонимика, комментарий)&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;p&gt;Доверие низкое. Потому что авторы не приводят фотографий, дают много ссылок на чужие работы, в которых также практически нет фотографий, и сами исследуют микроводоросли только в световой микроскоп, что ставит под сомнение находки некоторых видов. Не делайте так.&lt;/p&gt;
&lt;h3&gt;Доверие между единицей и двойкой&lt;/h3&gt;
&lt;div class="e2-text-picture"&gt;
&lt;img src="https://antonlyakh.ru/blog/pictures/Bukhtiyarova-1999-Diatoms-of-Ukraine.png" width="726" height="690" alt="" /&gt;
&lt;div class="e2-text-caption"&gt;&lt;i&gt;Bukhtiyarova L. N.&lt;/i&gt; 1999. Diatoms of Ukraine inland waters&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;p&gt;Нет фотографий, но даны ссылки на фото в других источниках и приведены места находок, что подтверждает объективность исследований. Кроме того, Людмила Николаевна — авторитетный диатомолог. Поэтому доверие к списку есть. Но если решите делать список, все-таки следуйте следующим примерам.&lt;/p&gt;
&lt;h3&gt;Доверие двоечка&lt;/h3&gt;
&lt;div class="e2-text-picture"&gt;
&lt;img src="https://antonlyakh.ru/blog/pictures/Sterken-et-al-2015.png" width="600" height="998" alt="" /&gt;
&lt;div class="e2-text-caption"&gt;&lt;a href="http://dx.doi.org/10.5091/plecevo.2015.1103"&gt;&lt;i&gt;Sterken et al.&lt;/i&gt; 2015&lt;/a&gt;&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;p&gt;Световые фотографии посредственного качества. Из-за этого сами авторы часто сомневаются в корректности определения видов. Это плохой пример для подражания. Хорошие примеры ниже ↓&lt;/p&gt;
&lt;h3&gt;Доверие между двумя и тремя&lt;/h3&gt;
&lt;div class="e2-text-picture"&gt;
&lt;img src="https://antonlyakh.ru/blog/pictures/Stidolph-plate-52-text.png" width="800" height="600" alt="" /&gt;
&lt;div class="e2-text-caption"&gt;Stuart R. Stidolph diatom atlas. Plate 52&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;p&gt;Все виды сопровождаются световыми фотографиями очищенных панцирей диатомовых. Хотя, в некоторых случаях, оптического разрешения недостаточно для уверенного определения видов, работа выполнена качественно.&lt;/p&gt;
&lt;h3&gt;Доверие между двумя и тремя&lt;/h3&gt;
&lt;div class="e2-text-picture"&gt;
&lt;img src="https://antonlyakh.ru/blog/pictures/Taylor-et-al-2007.png" width="800" height="570" alt="" /&gt;
&lt;div class="e2-text-caption"&gt;&lt;i&gt;Taylor et al.&lt;/i&gt; 2007. An illustrated guide to some common diatom species from South Africa&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;p&gt;Все виды сопровождаются световыми фотографиями, почти для всех даны прижизненные фото с протопластом, у многих есть электронные фотографии деталей панциря. Доверия высокое. Отличный пример для подражания.&lt;/p&gt;
&lt;h3&gt;Доверие троечка&lt;/h3&gt;
&lt;div class="e2-text-picture"&gt;
&lt;img src="https://antonlyakh.ru/blog/pictures/Saburova-2019.png" width="980" height="758" alt="" /&gt;
&lt;div class="e2-text-caption"&gt;&lt;i&gt;Al-Yamani F. Y., Saburova M. A.&lt;/i&gt; (2019) Marine phytoplankton of Kuwait’s waters. Vol. 2. Diatoms&lt;/div&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;p&gt;Превосходный список с превосходными иллюстрациями. Виды сопровождают фото живых клеток, СМ фото очищеных панцирей и СЭМ фотографии. Такие списки — редкость. Это превосходный пример для подражания.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;Если вы делайте также — напишите мне.&lt;/p&gt;
&lt;p style="text-align:center; margin: 3em 0"&gt;* * *&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;В мере доверия можно учесть разные показатели. Например, авторитет исследователя. (Кстати, как его измерить?) Сейчас:&lt;/p&gt;
&lt;blockquote&gt;
&lt;p&gt;&lt;big&gt;Простая мера доверия списку таксонов не учитывает вашу субъективную оценку работы исследователя.&lt;/big&gt;&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;
&lt;p&gt;Приведенная мера доверия отражает наличие или отсутствие изображений опубликованных видов. Она не учитывает ваши знания о профессионализме исследователя.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;Так, если оценивать качество работы, то моя оценка списку диатомовых Украины Л. Н. Бухтияровой (1999) — 10 из 10, ибо я знаю с какой тщательностью Людмила Николаевна готовит материал. А оценка, к примеру, списка Стеркена и ко. (2015) — 2 из 10, хоть там и есть световые фотографии створок диатомовых.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;br/&gt;&lt;br/&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;Придумайте свою меру доверия списку таксонов или усложните предложенную простую. Поделитесь находкой в комментариях.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;br/&gt;&lt;br/&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;Доверяй, но проверяй.&lt;/p&gt;
</description>
</item>


</channel>
</rss>