{ "version": "https:\/\/jsonfeed.org\/version\/1", "title": "Математик среди биологов: заметки с тегом виртуальная коллекция", "_rss_description": "Я немного умею складывать, но от вычитания у меня всегда кружится голова", "_rss_language": "ru", "_itunes_email": "", "_itunes_categories_xml": "", "_itunes_image": "", "_itunes_explicit": "", "home_page_url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/tags\/virtualnaya-kollekciya\/", "feed_url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/tags\/virtualnaya-kollekciya\/json\/", "icon": false, "author": { "name": "Антон Лях", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/", "avatar": false }, "items": [ { "id": "134", "url": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/vyrezaem-pixelnuyu-grafiku-iz-vectornogo-fayla\/", "title": "Вырезаем растровую графику из СВГ", "content_html": "

Столкнулся с задачей.<\/p>\n

Есть фотография большого размера (более 4 тыс. пикселей по ширине), на которой запечатлены части живых организмов.<\/p>\n

\n\"\"\n
Большая фотография с прикрепительными структурами плоского паразитического червя<\/div>\n<\/div>\n

Организмы — это паразиты. Мизерные примитивные червячки из класса Моногеней<\/a>, живущие на жабрах рыб. К жабрам они крепятся при помощи крючков.<\/p>\n

\n\"\"\n
Рисунок головы кефали из работы Световидова<\/a> (1964); рисунок жабр и сидящего на них паразита из работы Лопеса-Беленгуэра с сотоварищами (2015)<\/a><\/div>\n<\/div>\n

Разные виды червячков внешне очень похожи. Они отличаются только формой прикрепительных крючков. У каждого таксономического рода уникальная форма крючков, но среди видов одного рода различия форм не столь очевидны. Чтобы их обнаружить, надо использовать методы морфометрического анализа.<\/p>\n

\n\"\"\n
Метод главных компонент описывает разнообразие форм прикрепительных крючков разных родов моногеней. График из статьи Вигнона (2011)<\/a><\/div>\n<\/div>\n

Для выполнения морфометрического анализа мы оцифровываем форму крючков. Загружаем фотографию в Инскейп, обводим кривыми и сохраняем результат в СВГ.<\/p>\n

\n\"\"\n<\/div>\n

Проблема в том, что готовый файл слишком много «весит». Исходный джипег размером 800 Кб, после обводки и сохранения в СВГ, толстеет до 12 Мб. В результате мне присылают мегатонные свгешки с внедренной графикой, которые надо разместить на сервере, а он не резиновый.<\/p>\n

Я не могу выбросить фото и загрузить на сервер только векторные кривые. Потому что контуры обрисовывают несколько человек, у каждого свои особенности рисования, они ошибаются, и результаты надо перепроверять. А фотография помогает проверить правильность построения контуров.<\/p>\n

Я несколько часов пытался уменьшить размер свг-файла с графикой без потери качества. Попробовал уменьшить в Инскейпе, не получилось — размеры фотографии и свг-файла остались огромными. Потом разобрался с форматом и нашел решение.<\/p>\n

Формат СВГ поддерживает два способа хранения изображений.<\/p>\n

Первый, когда графический файл внедрен в СВГ. Это не оптимальный способ, потому что файл не сжат. Изображение состоит из последовательности символов в позиционной системе счисления с основанием 64<\/a> (base64). Отсюда 800 Кб превращаются в 12 Мб.<\/p>\n

\n\"\"\n
Фотография, внедренная внутрь свг-файла, занимает очень много места<\/div>\n<\/div>\n

Второй, когда СВГ хранит ссылку на внешний графический файл. Тогда СВГ содержит только описание кривых<\/a>, а фотография хранится отдельно. Размер свг-файла становится маленьким.<\/p>\n

\n\"\"\n
Отделил «мух» от «котлет»<\/div>\n<\/div>\n

Второй вариант подошел.<\/p>\n

Если бы файлов было мало, я бы все переконвертировал вручную. Но файлов много — несколько сотен.<\/p>\n

В результате написал скрипт на ПХП. Он извлекает из СВГ фотографию, сохраняет ее в виде отдельного джипега и вставляет в СВГ ссылку на этот джипег. Джипег хранится локально и называется так же, как и свг-файл.<\/p>\n

Скрипт умный. Если в разных файлах используется одна и та же фотография, скрипт сохранит ее всего один раз и во всех файлах будет правильно на нее ссылаться. Это экономит место.<\/p>\n

Скрипт для всех<\/b><\/a>.<\/p>\n

Эта заметка описывает этап создания виртуальной коллекции паразитов рыб Мирового океана<\/a><\/p>\n<\/div>", "date_published": "2017-02-26T11:03:37+03:00", "date_modified": "2021-06-10T19:08:26+03:00", "image": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/big-photo-of-ligophorus-haptor.jpg", "_date_published_rfc2822": "Sun, 26 Feb 2017 11:03:37 +0300", "_rss_guid_is_permalink": "true", "_rss_guid": "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/all\/vyrezaem-pixelnuyu-grafiku-iz-vectornogo-fayla\/", "_e2_data": { "is_favourite": false, "links_required": [], "og_images": [ "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/big-photo-of-ligophorus-haptor.jpg", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/ligophorus-on-liza-gills.gif", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/diversity-of-haptoral-hooks.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/digitized-hooks.gif", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/image-embeded-in-svg.png", "https:\/\/antonlyakh.ru\/blog\/pictures\/svg-jpg.png" ] } } ], "_e2_version": 3559, "_e2_ua_string": "E2 (v3559; Aegea)" }